Sitz des Landesamtes ist die Hansestadt Rostock. Die bisherigen Standorte der Ämter bleiben als Außenstellen des LAGuS erhalten. Außenstellen befinden sich in Greifswald, Neubrandenburg, Neustrelitz, Schwerin und Stralsund. Ein Organisationsplan und Organigramme der Dezernate liegen im PDF-Format vor.
Das Landesamt gliedert sich weiter in folgende Abteilungen: